- مركز واتا للاقتصاد الإسلامي
- مركز واتا للدراسات العسكرية
- مراكز دراسات أخرى:
- مركز واتا لدراسات الدفاع عن الإسلام
- مركز واتا للدراسات النقدية في الأدب العربي
- مركز واتا لدراسات الأدب المقارن
- مركز واتا لحقوق الإنسان
- مركز واتا للدراسات الإسرائيلية
- مركز واتا لدراسات دول المغرب العربي
- مركز واتا للدراسات المستقبلية للمنطقة العربية
- مركز واتا للدراسات الآسيوية
- مركز واتا للدراسات الأفريقية
- مركز واتا للدراسات والأبحاث الأندلسية
- مركز واتا للدراسات الشرقية
- مركز واتا للدراسات الأوروبية والأمريكية
- مركز واتا للدراسات السياسية والدولية والإستراتيجية
- مركز واتا للدراسات والاستشارات والخدمات القانونية
- مركز واتا للدراسات والأبحاث البيئوية
- مركز واتا للدراسات التربوية